分子诊断专家韩健:重新启动基因测序的是与非
2022-01-24 12:50 来源:长春男科医院
最近两周在国外,听到议论最多的就是有关国内安东生计生委放通报取消基因侦测关键技术的病症广泛应用的大事。
有关高通量基因组产前病症,我仍然讨论过不少(参见作者新浪该网站。编者注)。可是对安东陶铸的突然取消,还是有些思绪值得和大家互动。
首先,我认为取消是对的。既然国内有相关立法,就要按照立法程序办:Corporation不该按照程序申领商品。似乎这是一个很突然的重新考虑,其实也是这不。安东陶铸也是无奈,他们多次调解相关Corporation,两三年来一直被顶着。如果不管,一旦出大事,职责就首先在国内该机构。
取消不是说是方法不科学研究,取消是说是一些Corporation的不应令人担忧,存在风险。按照安东陶铸的说明了,高通量基因组的仪器,试剂,软件,都无法经过病症解析,所以取消。
下图是我基本上介绍过的宾夕法尼亚州SequenomCorporation关键技术总监演讲的一个幻灯片:
无创产前病症的最主要问题就是母血当中新生儿DNA浓度小(平均13%)而且变化仅限于长三(2%~35%)。就是说是,有的怀孕血当中新生儿DNA比较多,有的则很少。这就给此例造就一个很复杂化的问题:如何能精准基本原理每个怀孕血浆当中新生儿DNA的浓度?
有关关键技术问题,我建议大家去读读无创产前病症关键技术的先行者,香港科技大学的Dennis Lo的有关研究成果。据他介绍,如果母血当中新生儿DNA占有游离DNA总数的10%,那么,多一条21号染色体所造就的“多余”频谱仅仅是新生儿DNA的5%。这么略微的上升并不需要非常精确的定量方法才能侦测到。宾夕法尼亚州年所做无创产前病症的Corporation,也是和Dennis合作的Corporation,Sequenom,有独特的定量方法,通过侦测甲基化DNA在母血当中的数目来矫正实验误差。
国外Corporation是如何定量的?更为让我责怪的是,因为挑战激烈,国外Corporation共享无创产前病症的费用都远远高于于国外的价钱。因为IlluminaCorporation共享的试剂价钱是一定的,所以利润空间依赖于。能把价钱降高于得这么高于,就并不需要把许多病人遗骸分拆起来三人基因组(pooling), 一次基因组混合成的遗骸就越多,平均价钱就就越便宜。国外也pool,但是pool的大小并不需要规范病症解析。pool得就越讥讽,侦测那5%DNA增幅的敏感性也就就越高于,实为阴性的几率就就越大。所以,在关键技术上,国外和国外比仍然走样了,也就更为并不需要通过规范的病症解析来证明这是切实可行的。
安东陶铸的这个取消通报,让我们联想到九十年代当中期取消PCR的有关明文规定。当时取消PCR病症也是因为该关键技术被滥用,扩增产物污染普遍,实为阳性结果乡间可见,安东生部设法取消进行改革。
可是,是不是有人想过,当当中期取消PCR和今天取消基因基因组给当中国生命体医护产业造就了什么因素?当当中期取消PCR是不是因为无法及时病症上升了社可能会肝炎病患的总数?取消PCR是不是使得许多在生命体关键技术从业人员实业的Corporation丧失了转回国际消费市场的机可能会?取消林氏无创产前病症是不是可能会上升早产儿出生率?尽快准入对科学研究和社可能会都有好处。
所以,虽然我赞成安东陶铸有关取消的明文规定,但是我更为期望安东陶铸能网掀开一面,让新关键技术、新商品有更为多的机可能会转回病症实践。安东陶铸援引有“主干”,可是,无论是非典,还是疫情,都证明那个“主干”实际上操作起来很难,人为太多,不够薄膜。
一个现成的的系统就是宾夕法尼亚州不断改进的CLIA(Clinical Laboratory Improvement Amendments)。 CLIA不归FDA管,而是另外一个政府该机构CMS(The Centers for Medicare & Medicaid Services)管,负责管理近25万个研究室。FDA管Corporation生产出来的商品,而CMS则管研究室客户服务。只要是有CLIA执照的研究室,他们自己研放的制剂、关键技术等也可以合法转回病症,合理收费。
不过,最近FDA也多次援引要阻挠管理CLIA研究室,因为基本上无法快递金融业务,研究室客户服务仅限于依赖于,所以风险依赖于。一旦出大事,因素不大。可是现在有了快递金融业务,一个研究室的客户服务对象可以覆盖全国,所以相应的风险也上升了,和Corporation的商品不相上下。
可是,如果无法CLIA研究室的系统,新关键技术只有通过了FDA才能转回病症,那很可能宾夕法尼亚州也不可能会带进医护病症从业人员的创新核心人物。宾夕法尼亚州有4个共享无创产前病症的Corporation,无法一个是FDA批准的,都是CLIA。
当中国不该借鉴宾夕法尼亚州CLIA的系统,取消商品,启动客户服务。这样即能支配风险,也能加速新关键技术的病症广泛应用。掀开放类似CLIA的研究室管理的系统,可能会欣赏大量社可能会银行贷款,大幅提高医护总质量和高效率。但愿两可能会期间有代表提出相关议案。
精彩互动(摘自新浪微博):
@切线:取消商品,掀开放客户服务。客户服务要由行政监督,外科医生与地质学家组成委员可能会来断定精准性。好不容易各种皮包Corporation雨后春笋般冒出来名副其实可以基因基因组得出结论生活品质与素质及各种疾病,还有有钱不赚非时人的基因组Corporation们也居然要出自闭症病症基因组的时候,再进一步不取消就要出大乱子了!
@AfterToday:关键技术符合监管机构的立即是对的。但“如何能精准地分析每个怀孕血浆当中新生儿DNA的浓度?”为最主要难题,韩博士,怎么感觉您完全外行呀,哎,多想想历史文献吧。说是说是国策没人知道您本意。sequenom不pool样本?
@生命体关键技术创新实业-韩健 回复 @AfterToday 对博文 【安东陶铸取消基因基因组的是与非】的华盛顿邮报: "Sequenom当然pool, 不过无法pool得那么讥讽。我是外行?林氏筛查我不是医学专家,是家专,两代人的努力。你自己多想想历史文献吧。"
@AfterToday:嗯,血浆筛查您是家专,拿酶连和时间分辨挑战,勇气可嘉。诚然,在无法法规的时候,总有人可能会不择手段,国外并不需要的是标准和监管机构。但不会因为取消就说是国外有种种“社会上”。您看到社会上了?不对说是国外混得讥讽?有资料?有判读?
@生命体关键技术创新实业-韩健 回复 @AfterToday 对博文 【安东陶铸取消基因基因组的是与非】的华盛顿邮报: "我并无法说是国外有社会上。只是说是取消有理。无法社会上更为好,按照指导方针申领,有何不妥?我更为期望借机另掀开转回消费市场的的系统,让CLIA的系统在国外启动。"
@AfterToday:批评您说是的最主要难题是如何精准侦测新生儿DNA浓度;您想想您是筛查家专,说是国外比sequenom混得讥讽;批评您如何知道国外混得讥讽;绕回去又说是原文当中的CLIA……您是医学专家!
@Whale-T:“通报”里面有个第四条。
@聂超Nick:就大事论大事,韩老师说是的有道理。
@生命de工程师:CLIA验证对于研放和生产是非常适合的。
作者简介:韩健,宾夕法尼亚州HudsonAlpha研究院研究员。从大事分子鉴别病症模拟器关键技术的掀开放和自体组库基础工程关键技术。
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